Syntetiska receptorer kan hitta molekylära förändringar
Forskare vid Malmö universitet har utvecklat syntetiska receptorer som kan isolera proteinfragment med fosfatgrupper på exakt definierade positioner. Tekniken kan på sikt förbättra diagnostiken för bland annat cancer.
Fosforylering innebär att en fosfatgrupp binds till ett protein och därigenom påverkar proteinets aktivitet. Det är inte bara förekomsten av fosforylering som är biologiskt betydelsefull, utan även dess exakta placering. Fosfatgrupper på närliggande aminosyror kan förmedla helt olika signaler. Onormal fosforylering förekommer vid flera sjukdomar, däribland cancer, och är mål för behandling med kinasinhibitorer.
Anil Incel, forskare vid institutionen för biomedicinsk vetenskap vid Malmö Universitet.
– Det handlar om var den så kallade fosforyleringen sker och hur stor del av proteinet som modifieras. Två proteinfragment kan se nästan identiska ut, men ändå bära på helt olika biologisk information. I vårt fall ville vi kunna skilja mellan fosforyleringar som endast ligger en aminosyra ifrån varandra, säger Anil Incel, forskare vid institutionen för biomedicinsk vetenskap vid Malmö Universitet i ett pressmeddelande.
Forskargruppen, ledd av Anil Incel och Börje Sellergren, har använt tekniken molecular imprinting för att framställa molekylärt präglade polymerer, MIP. Dessa innehåller nanometerstora hålrum vars form och kemiska egenskaper är anpassade för ett specifikt proteinfragment. Receptorerna kunde därmed skilja mellan fosforyleringar som endast låg en aminosyra från varandra, även i prover med tusentals strukturellt liknande molekyler. Vanliga analysmetoder som antikroppar och masspektrometri kan ha svårt att identifiera sällsynta fosfopeptider och närbesläktade molekylvarianter i komplexa prover. De syntetiska receptorerna är kemiskt stabila, reproducerbara och möjliga att lagra under lång tid. Tekniken kan därför bli ett robust och kostnadseffektivt komplement inom diagnostik och individanpassad cancerbehandling.
– Vi hoppas att vår teknik kommer att öka acceptansen av syntetiska antikroppar inom life science-området då den erbjuder ett kostnadseffektivt och robust alternativ till antikroppar, säger Anil Incel.
